基因工程的应用有如下：
1、转基因鱼
生长快、耐不良环境、肉质好的转基因鱼（中国）。
2、转基因牛
乳汁中含有人生长激素的转基因牛（阿根廷）。
3、转黄瓜抗青枯病基因的甜椒。
4、转鱼抗寒基因的番茄。
5、转黄瓜抗青枯病基因的马铃薯。
6、不会引起过敏的转基因大豆。
7、超级动物
导入贮藏蛋白基因的超级羊和超级小鼠。
8、特殊动物
导入人基因具特殊用途的猪和小鼠。
植物基因工程：主要是育种，培育抗性、高产的新品种。动物基因工程：提升畜禽的生长速度、改良品质利用转基因动物生产特种蛋白因子；动物基因工程器官可以用于拯救生命；转基因动物模型可以用于基础研究、疾病机理研究、筛选药物等。
细菌基因工程：合成化学方法难以合成的药物；用环境微生物治理环境；改良食品、饲料及其他工业生产菌的性能；基因工程菌还辅助农业，使少病虫害等。
病毒基因工程：研制基因工程病毒疫苗；用作杀虫剂；用作载体用于基因治疗。
医药基因工程：疫苗、抗体、核酸类药物、基因治疗。
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