指单位体积中的细菌、霉菌、酵母等微生物的群落总数。也指1 mL水样在牛肉膏蛋白胨琼脂培养基中，于37 ℃培养24 h后所生长的腐生性细菌菌落总数。
在活菌培养计数中，由一个或多个生物体在固体培养基上生长繁殖形成的菌落称为菌落形成单位，表示活菌的数量。菌落形成单位的计数方法不同于一般的计数方法。一般直接在显微镜下计算菌体数量会将活与死的菌体全部算入，但是CFU只计算活的菌体数量。
扩展资料：
中国现行《生活饮用水卫生标准》（GB5749-2006）规定，细菌菌落总数在1 mL自来水中不得超过100个。细菌种类繁多，有其自身的生理特性。它们必须在适合它们生长的培养基中培养。
然而，在实践中并不容易做到，因此腐生菌通常在适合大多数细菌的培养基中培养，其菌落总数表明了有机污染的程度。水中细菌总数与有机污染程度呈正相关。因此，细菌总数是评价水体污染程度的重要指标。细菌总数越大，水污染越严重。
参考资料来源：百度百科-CFU
参考资料来源：百度百科-细菌菌落总数
菌落形成单位（CFU，colony-forming unit），音标：ˈkɑləniː-ˈfɔrmɪŋunitˈjuːnət。
指在活菌培养计数时．由单个菌体或聚集成团的多个菌体在固体培养基上生长繁殖所形成的集落．称为菌落形成单位，以其表达活菌的数量。菌落形成单位的计量方式与一般的计数方式不同，一般直接在显微镜下计算细菌数量会将活与死的细菌全部算入，但是CFU只计算活的细菌。
因此，可将菌液倍比稀释成不同浓度，每种浓度吸1毫升加到融化温度达50度的15毫升营养琼脂培养中混匀使其凝固，置35度孵育24小时，取出进行菌落计数，每个平板菌落数X稀释倍数得到每毫升中细菌数量，取平均值即可得到较准确的CFU/ml，一般对平板进行菌落计数，选择菌落数在30到300个平板为准。
使用
1、倾盘法，其中样品使用冷却至约40-45°C（刚好高于凝固点，以使热诱导的细胞死亡最小化）的熔融琼脂悬浮在培养皿中。营养琼脂固化后，将板孵育。
2、扩散板法，其中将样品（小体积）分布在营养琼脂板的表面，并在孵育之前干燥以进行计数。
3、膜过滤器方法，其中样品通过膜过滤器过滤，然后将过滤器放置在营养琼脂平板的表面（细菌朝上）上。在孵育过程中，营养物质会通过过滤器浸出，以支持正在生长的细胞。由于大多数过滤器的表面积小于标准培养皿的表面积，因此板数的线性范围会较小。
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