核基因是真核生物中位于细胞核内染色体上的基因，通过指导蛋白质的合成来表达自己所携带的遗传信息，从而控制生物个体的性状表现。
基因有两个特点，一是能忠实地复制自己，以保持生物的基本特征；二是基因能够“突变”，突变绝大多数会导致疾病，另外的一小部分是非致病突变。非致病突变给自然选择带来了原始材料，使生物可以在自然选择中被选择出最适合自然的个体。
含特定遗传信息的核苷酸序列，是遗传物质的最小功能单位。除某些病毒的基因由核糖核酸（RNA）构成以外，多数生物的基因由脱氧核糖核酸（DNA）构成，并在染色体上作线状排列。基因一词通常指染色体基因。在真核生物中，由于染色体都在细胞核内，所以又称为核基因。位于线粒体和叶绿体等细胞器中的基因则称为染色体外基因、核外基因或细胞质基因，也可以分别称为线粒体基因、质粒和叶绿体基因。
质基因与核基因区别为：位置不同、遗传方式不同、基因组不同。
一、位置不同
1、质基因：是指细胞质中存在的一个个基因。
2、核基因：是真核生物中位于细胞核内染色体上的基因。
二、遗传方式不同
1、质基因：细胞质基因遗传方式为母传子代
2、核基因：核基因遗传方式为父传子代
三、基因组不同
1、质基因：相应的全部细胞质基因构成一个细胞质基因组，其中包括线粒体基因组和叶绿体基因组等。
2、核基因：核基因组是一个单纯的DNA或RNA分子，因此又称为基因带，通常也称为它的染色体。
参考资料来源：
百度百科——细胞质基因
百度百科——核基因
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