因为噶尔丹是一个有志向和才能的人，放过他只会让自己后患无穷，因此康熙三征噶尔丹，为了彻底解决这个隐患。
一、噶尔丹的志向是攻占满清王朝。噶尔丹的才能从小就被人挖掘，他的学习能力特别强，精通五种语言，这也为他后来向沙俄寻求帮助做基础，他成功继承他哥哥的意志消灭敌人，获得准噶尔地区的统治权，他不仅仅是智力高，而且武力还高，他曾率领着部队冲锋在前斩杀敌方数百名前锋。本来清政府不想管他的，默认将准噶尔的统治权给他，但是他暴露出了他的野心，他将在北京买来的汉人制品全部焚烧，代表着他不会因为享乐而出现惰性，康熙就开始注意到他，觉得他是一个有大志向的人，如果放任不管的话会对清朝统治制造成威胁。
二、噶尔丹扩大自己的势力，并且挑衅康熙。噶尔丹努力与沙俄交好，邀请沙俄的商人来到我国进行贸易，并且噶尔丹开始清扫他周边的势力，将其全部纳入自己的势力当中。噶尔丹清理周边势力完之后，将河西走廊地区的势力也清理完了，并且开始西征扩大自己的势力，而在击败鄂齐尔图车臣汉之后，他还将获得的大部分战利品送给了康熙，这里包含挑衅和示威的意思，康熙也开始计划什么时候去讨伐他。
三、康熙三征噶尔丹，将其彻底消灭。因为噶尔丹自己势力的内部原因发生了政治纠纷，导致其势力受损，然后康熙趁之讨伐噶尔丹，然后将其势力击溃，但是却被噶尔丹给逃走了。经历了5年修养之后，噶尔丹整军向巴彦乌兰地区发起进攻，康熙再次派人去镇压他，然后将其主力部队全部消灭，但是还是没有抓住噶尔丹。康熙第三次讨伐噶尔丹的时候，他已经成了没人支持的头目了，其他人都想要投降，而沙俄也不再愿意帮助他了，然后噶尔丹便在众人面前自刎了。
清圣祖仁皇帝爱新觉罗·玄烨，也就是我们通常所说的康熙皇帝，他是清朝的第四位皇帝，同时也是清入主北京城的第二位皇帝。他八岁的时候登基为帝，十四岁就已经开始亲政，在位六十一年，是中国历史上在位时间最长的皇帝。
康熙帝时后世人最熟悉的封建帝王之一，同时也是清朝历史上最伟大的皇帝，被后世学者称为“千古一帝”。康熙在位之时所做的一些功绩，功在当代，利在千秋。
他少年时败鳌拜，年长时平三藩收台湾，更是亲政噶尔丹，保卫雅克萨，以尼布楚条约确定了清王朝在黑龙江流域的领土权。康熙是中国统一多民族国家的捍卫者，同时也是清朝盛世的奠基人，在清朝历史上地位极高，去世后上谥：“合天弘运文武睿哲恭俭宽裕孝敬诚信功德大成仁皇帝”。
康熙帝亲征噶尔丹，不仅仅是一次简单的征战。噶尔丹是一位野心勃勃之人，最重要的是还像野草一样“野火烧不尽，春风吹又生”，如果不将他连根拔起，便会死灰复燃。所以在历史上，康熙帝三次亲征噶尔丹，最终挫败噶尔丹的野心。
第一次亲征噶尔丹，是在噶尔丹取得对卫拉特蒙古准噶尔部的统治权，继承汗王之位后。噶尔丹获得权力之后，便开始了对周边地区的占领。他两次出兵占领哈密、吐鲁番，康熙二十九年的时候更是以派兵帮助天山南路 *** 教“白山派”首领阿帕克和卓与“黑山派”争斗为由，出兵乘机攻占南疆地区，将喀什噶尔和叶尔羌握在手中。康熙二十六年，又以为弟报仇的理由，向喀尔喀蒙古发兵。
消息传来后，康熙帝以安亲王岳乐，简亲王雅布等人为将，调青海等地士兵，发布谕令亲征噶尔丹。噶尔丹到呼伦贝尔的时候，康熙帝调盛京兵一千名，会和科尔沁骑兵一万驻守，噶尔丹退走。随后在喀喇鄂博的领地，康熙帝调八旗子弟兵和火器营兵1000名等各地兵士将噶尔丹镇压。
康熙二十九年，噶尔丹在沙俄殖民者的支持和怂恿下，再次集兵，六月入乌尔会河以东地区。尚书阿喇尼领兵前往阻击，兵败！噶尔丹因此从乌尔会河，轻松进入乌珠穆沁地。噶尔丹再次起兵，让康熙帝意识到，如果不能彻底将噶尔丹除掉，那么势必还会再有祸患。于是康熙帝派兵布阵，涉及诸大臣数十人，其中有命裕亲王福全、皇子允、恭亲王常宁、简亲王雅布、信郡王鄂札副之、内大臣佟国纲、佟国维、索额图、明珠、阿密达、都统苏努、喇克达、彭春、阿席坦、诺迈，护军统领苗齐纳、杨岱，前锋统领班达尔沙、迈图等。康熙帝想要一举将噶尔丹除去，不过后来因病，亲征的康熙帝返回京城。后来福全虽然将噶尔丹的军队大败，但是最终还是因为中了噶尔丹的患病之计，让噶尔丹带残兵逃脱。
康熙三十五年，康熙帝再次亲征，以三路清军约期夹攻。这一次噶尔丹还不等康熙帝等人亲自动手，自己就暴毙。噶尔丹死讯传来，准噶尔叛乱才算彻底了结。
噶尔丹从兄弟手中接过大权之后，便想要恢复昔日蒙古帝国的容光。但是要想建立这样一个统一而强大的帝国，势必会引起清 *** 的反弹。初时之时，噶尔丹并没有露出獠牙。但是随着势力的不断发展，最终向南疆、喀尔喀蒙古伸出了手。
噶尔丹的这一动作，当然引起了清 *** 的注意，很快就调兵防卫。噶尔丹三次反叛失败，除了当时清 *** 在康熙帝的领导极为强盛之外，最根本的原因还是在于他们内部的原因。
噶尔丹的首领之位，是杀掉政敌得来的，内部不稳就迅速发动战争，自然后患无穷。所以在后来行兵打仗之时，与噶尔丹同牧的僧格之子策妄阿拉布坦、索诺木阿拉布坦、丹津鄂木布均已成年，噶尔丹视他们为准噶尔汗位的潜在争夺者。两方爆发巨大矛盾，使得噶尔丹势力受到削弱，被清 *** 轻松打败。
另一方面，康熙帝的亲征，极大的增强了清军的气势。得道多助，失道寡助，内有政敌牵制，外有强敌当前，噶尔丹的失败可想而知。
第一次是康熙二十九年（1690年）的乌兰布通之战，清军大破噶尔丹以万余骆驼组成的防御营地（驼城），噶尔丹败归科布多，伺机而动。第二次是康熙三十五年（1696年）的昭莫多之战，清军歼敌数千，击溃噶尔丹主力军队，噶尔丹兵败流窜。
最后一次是康熙三十六年（1697年），康熙帝带兵渡过黄河亲征。这时候，噶尔丹原来的根据地伊犁已经被他侄儿策妄阿拉布坦占领；他的左右亲信听说清军来到，也纷纷投降，愿意做清军的向导。噶尔丹走投无路，就服毒自杀。
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