秉承六部政令加以贯彻执行的事务机构有九寺五监。九寺是：太常寺、光禄寺、卫尉寺、宗正寺、太仆寺、大理寺、鸿胪寺、司农寺和太府寺。五监是：国子监、少府监、将作监、军器监和都水监。九寺五监也是中央的重要机构。
中央的监察机构是御史台，以御吏大夫、御史中丞为长官，主要掌纠察百宫和监督府库出纳，可以说是"天子耳目"。御史大夫下分设台院、殿院和察院。台院置侍御史，掌弹劾中央的百官，殿院置殿中侍御史，掌纠察朝仪、朝会、郊祀及巡视京师，以维护皇帝的尊严；察院置监察御史，掌监察地方官吏。
中央的司法机构有：大理寺，是最高的审判机构；刑部，是司法行政机构；御史台，负责监督大理寺和刑部的司法审判活动。每遇重大案件，大理寺卿会同刑部尚书和御史中丞共同审理，称"三司推事"，即后世"三法司"的前身。
尚书：今天的各个部，如公安部，财政部等等，只是主管一个部门的。中书：相当于国务院总理及副总理，总理办公会议，中央决策的。
门下：相当于国务院的办公厅，发文，上传下达的作用。
1.尚书省
中国魏晋至宋的中央最高政府机构之一。始名尚书台，后称尚书省。是由汉代皇帝的秘书机关尚书发展起来的。秦及汉初，尚书是少府的属官，是在皇帝身边任事的小臣，与尚冠、尚衣、尚食、尚浴、尚席合称六尚，因其在殿中主管收发（或启发）文书并保管图籍，故称尚书。三国时，尚书台已正式脱离少府，成为全国政务的总汇。因为它威权升高，引起最高统治者的疑忌，所以最高统治者又开始剥夺它的权力。曹操为魏王时，置秘书令，典尚书奏事。魏明帝时，中书监、令号为专任。于是在尚书台之外复有中书省，而原来作为皇帝侍从的侍中也逐渐成为参预机密的要职，尚书台不再有独占机枢的地位。东晋以后，录尚书之权渐分，有时以三四人并录尚书事。宋孝武帝孝建中，为防大臣威权过盛，遂省去录尚书之职，以后置废不常。西晋灭亡后，在北方建立的十六国，除前凉、西凉遥奉江南正朔，不立尚书台外，其余政权均有尚书令、仆射、尚书等官职。北魏出自鲜卑族，有部落大人会议决事的制度，魏道武帝拓跋珪破后燕，皇始元年（396）始仿魏晋立尚书台，置三十六曹。东魏、北齐承袭北魏，而尚书之权较重。西魏时，宇文泰以大行台执政。大行台的组织略同于尚书省，有仆射、尚书、丞、郎等职。隋文帝杨坚代周称帝，于开皇元年（581）恢复了尚书省，并使之成为名副其实的全国最高行政机构。唐沿隋制，也是三省（尚书、门下、中书）并置，而尚书省事无不总，是全国行政的总汇机构。唐代后期，尚书省已有名无实。北宋初，形式上还保留尚书省的组织系统，但权力既不归属，郎官又不治事，权借此以寄禄秩，别无差遣，尚书省的制度名存实亡。辽、金有尚书省，与宋制略同。元代以后，尚书省遂废除。
尚书省之组织，至隋而定型，尚书皆以部为名，而郎官以司为名。有吏部、礼部、兵部、刑部、民部、工部等六部及吏部、主爵等24司。
2.中书省
中国古代中央最高政府机构之一。汉武帝以主管文书的尚书掌握机密要政。为便于出入后宫，用宦者担任，称为中尚书，简称中书，又因兼谒者之职，故又名中书谒者。其长官有令、仆射。成帝时废除由宦者担任中书之制，此后至东汉末，改以士人为尚书。东汉末，曹操设立秘书令，典尚书奏事。曹丕改秘书为中书，设监、令各一人，监、令之下置中书郎若干人，于是中书省正式成立。此后，诏令文书起草之责由中书省官员担任，故机要之权逐渐移于中书省。西晋以后，历代都沿袭曹魏立中书省。隋代废六官制，置内史省，即中书省。唐初亦名内史省，武德三年（620）始复名中书省。自魏晋以后，中书省是与尚书省、门下省鼎立的三省之一。中书省的组织，历代均有变化，其员额历代不同。中书省最重要的职权是撰作诏令文书。中书令在唐前期与侍中、仆射同为真宰相。政事堂初设于门下省，高宗死后，移至中书省。此后，中书令执政事之笔，有出令之权，遂居宰相之首。由于翰林学士逐渐成为重要诏令的起草者，到了唐代后期，中书省也大权旁落。北宋前朝，中书省仅存空名，所掌只是册文、复奏、考帐等例行公事。宰相办公处称中书门下，简称中书（习称政事堂），置于皇城之内，不再设于中书省。南宋时，中书省与门下省合并为中书门下省，右仆射兼中书侍郎改称右丞相，中书侍郎改称参知政事。辽以南面官治汉人，其南面朝官亦沿唐制有三省之名。中书省初称政事省，兴宗时改。金熙宗完颜亶官制改革，掌诏敕者为翰林院，故中书省徒有虚名。后罢废。蒙古中统元年（1260）忽必烈即位后，始采用中原官制，设立中书省以总理全国政务，为最高行政机构，其设官沿袭金尚书省之制，长官中书令由皇太子兼任，未立皇太子时则缺。中书省领六部。在统一全国过程中，各地区相继分立行中书省，总隶于中书省；山东、山西、河北及内蒙古部分地区 ，则由中书省直辖 ，称为“腹里”，即内地的意思。明初沿袭元制，置中书省总理全国政务，领辖六部，职权甚重。洪武十三年（1380），朱元璋杀丞相胡惟庸，乘机废中书省，以六部分掌庶政，直接受命于皇帝，中央集权空前加强。
3.门下省
中国魏晋至宋的中央最高政府机构之一。初名侍中寺，是宫内侍从官的办事机构，后来发展成为与尚书省、中书省鼎足而立的三省之一。其称为门下省，始自西晋。门下省的组织历代不尽相同，但均以侍中为其长官，黄门侍郎(或称给事黄门侍郎，后改称门下侍郎)为其副。门，指皇宫内门，因其门户漆以黄色，故又称黄门。至唐代，其下属有给事中、散骑常侍、散骑侍郎等官职。这些官职大都来源于汉代宫廷侍从。门下省所统的下属机构，历代也不一致。侍中权重位高，在唐代前期是真宰相，宰相议政的政事堂，最初也设在门下省，以后才移到中书省。侍中具有封驳权，即对皇帝颁发诏书的审核权。黄门侍郎职掌与侍中相同。唐代以同中书门下三品或同中书门下平章事为宰相者，多以门下侍郎或中书侍郎为本官。给事中职掌读署奏抄，驳正违失，具体执行门下省的封驳权，地位至为重要。散骑常侍、散骑侍郎等官，职掌侍从规谏，实际上是位望通显而无具体职事的闲职，仅用来作为高级官吏的荣誉衔。门下省在宋代形式上还存在，实际职权已移至其他机构，其长官成为寄禄虚衔。辽代南面官系统中有门下省，职掌、官名、员额与宋制略同。金废除门下省。元代以后，门下省不再设置。
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