淮河一部分流入黄海，一部分通过大运河流入长江。应该主要注入黄海。
清朝咸丰以前，黄河从淮河进入黄海。后来由于黄河大量淤积，淮河入海口被堵，淮河水被迫从京杭大运河流入扬州长江。然而，由于大运河狭窄，流量有限，过去淮河两岸经常发生洪水。
建国后，为解决淮河水患，修建了苏北灌溉总渠，沿灌溉总渠将淮河水引入黄海。同时方便两岸农业区的灌溉。
目前淮河主要流入黄海，还有一部分通过大运河流入长江。
历史上淮河注入黄海。现在，淮河和洪泽湖是淮河的下游，有三个入海口。经主流三河闸，经宝应湖、高邮湖流入三江营长江，从而进入河道，全长约1000公里，再流入东海；另一侧离开洪泽湖东岸的高良涧水闸，经苏北灌溉总渠在扁担港进入黄海。第三路出洪泽湖东北岸的赫尔门，过胡爱书河，在洪水口注入海州湾(黄海)。
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